Vào ngày 30 tháng 11 năm 1815, tại Kinh thành Viên, Đế quốc Áo, Maria Antonia kết hôn với Thân vương Ferdinand xứ Sachsen-Coburg và Gotha.[1] Ông là anh trai của Thân vương Leopold, Vua tương lai của Vương quốc Bỉ.[2] Để môn đăng hộ đối với một thân vương, Hoàng đế Franz Joseph I của Áo đã phong cho cha bà làm Thân vương Koháry xứ Csábrág và Szitnya trong giới quý tộc Áo vào ngày 15 tháng 11 năm 1815, hai tuần trước đám cưới của bà (tổ tiên của họ đã được phong làm bá tước trong giới quý tộc Hungary vào tháng 7 năm 1685 và nam tước vào tháng 2 năm 1616), qua đó bà trở thành một thân vương nữ.[1]

Năm 1826, sau cái chết của cha bà, Maria Antonia được thừa kế hơn 150.000 ha đất ở Hạ Áo, Hungary và Slovakia ngày nay, bao gồm các điền trang, rừng, hầm mỏ và nhà máy, tổng tài sản lên đến 20 triệu franc. Theo danh sách tài sản đính kèm với hợp đồng hôn nhân của con trai bà, Thân vương tử August, vào thời điểm ông kết hôn với Vương nữ Clémentine của Orléans năm 1843, tài sản của Nhà Koháry bao gồm Palais Koháry ở trung tâm Viên và một số trang viên ở Viên, một ngôi nhà mùa hè và vùng đất ở Ebenthal, Hạ Áo, các điền trang ở Áo tại Velm, Durnkrut, Walterskirchen, Bohmischdrut và Althoflein, cũng như hàng chục trang viên ở Hungary, lãnh địa của Kiralytia và một biệt thự ở Pest.[2] Cuối năm 1868, khi cháu trai của Antónia là Thân vương tử Ferdinand, Công tước xứ Alençon, kết hôn, người ta ước tính rằng ông và ba anh chị em của mình sẽ được thừa kế tổng cộng 1 triệu franc chỉ từ phần tài sản của bà nội quá cố của họ.[2] Cho đến Chiến tranh thế giới thứ nhất, hậu duệ của bà, nhánh Koháry của Nhà Sachsen-Coburg và Gotha, nằm trong số ba chủ đất lớn nhất ở Hungary.

Maria Antonia qua đời ở Viên vào năm 1862, và được chôn cất trong lăng mộ công tước ở Friedhof am Glockenberg, (nghĩa trang Glockenberg) ở Coburg.[3]